中国电子检验检疫即通过应用信息化手段和改革检验检疫监管模式，实现对检验检疫对象从申报到检验检疫、签证放行全过程的电子化。电子检验检疫具有三大功能：电子申报、电子监管、电子放行。　　电子申报--是指通过网络，企业足不出户就可以进行申报，目前已经进行电子申报的业务有：出入境货物申报、产地证申报、检疫许可证申报、旧机电产品备案申报、金伯利证书申报。
　　电子监管--是指在检验检疫工作前推后移、改革原有监管模式的基础上，应用信息化管理全过程，大大提高工作效率。电子监管包括：出口货物前期管理、出口货物快速核放、进口货物快速查验。出口货物前期管理包括建立企业电子档案，对出口货物监管前推，从源头管理，在生产过程排布关键控制点进行严密检验检疫检测，实时提取电子数据，实现严密监管和工作前推。出口货物快速核放是指将出口企业日常监管信息、生产过程实时检验检疫结果和标准规定要求存入监管数据库。报检时，只需将数据进行比对，成功后即可放行。进口货物快速查验是实现检验检疫机构与港务部门的网络互联、信息共享。货物到港前，该系统可提前获取港务部门相关电子信息，并对进口货物到货信息自动核查核处理。货物到港后，按检验检疫不同要求查验核放。
　　电子放行--电子放行是实现检验检疫与海关之间、检验检疫机构之间在通观放行信息上的互联互通，有效提高通关验放效率。电子放行包括电子通关、电子转单和绿色通道制度。电子通关是检验检疫机构与海关通过口岸电子执法系统实现电子共享，完成检验检疫通关单电子数据的传输，为企业接神时间。电子转单是产地检验检疫机构向口岸检验检疫机构发送换证品单电子数据，企业可直接在口岸凭转单凭条即可换发通关单，为企业快速直通服务。“绿色通道”制度，是按照分类管理原则，对安全质量风险小、诚信度高的企业的出口货物，产地机构检验后，口岸机构免于查验，直接向海关发送电子通关单货签发通关单，形成绿色通道。自去年８月起在京、津两地实施“绿色通道”制度试点以来，目前全国获得“绿色通道”通行证的有上千家企业，“绿色通道”制度受到了企业和政府部门的热烈欢迎。国家质检总局已于2003年以局长令发布了《出口货物实施检验检疫绿色通道制度管理规定》。按照国家质检总局的部署，到今年底和明年初，实行出口商品“绿色通道”制度的企业力争达到２０００家。